Theo thống kê chính thức của Giáo hội Công giáo năm 2018, số tín hữu Công giáo Nhật Bản là 440.893, chiếm khoảng 0,3% trong tổng số 127 triệu dân.
Tuy nhiên, nếu tính cả con số các tín hữu không đăng ký vào các giáo xứ, con số đúng thực có thể là nhiều gấp đôi. Phần lớn tín hữu không đăng ký không phải là người Nhật; nhiều giáo phận tại Nhật có số tín hữu ngoại quốc nhiều hơn tín hữu người Nhật. Nhiều người trong số không đăng ký là những người cư trú bất hợp pháp và từ chối đăng ký tên vì sợ thông tin của họ bị cơ quan nhập cư và cảnh sát biết.
Tokyo có số tín hữu đông nhất
Các tín hữu Công giáo cư trú nhiều nhất ở khu vực Tokyo, thủ đô của Nhật Bản, đô thị lớn nhất thế giới với gần 37 triệu dân (hơn ¼ dân số nước này). Ba giáo phận Tokyo, Yokohama và Saitama, trong khu vực đô thị Tokyo, có 174.878 tín hữu Công giáo, trong đó 97.656 người thuộc tổng giáo phận Tokyo.
Sau Tokyo, khu vực tập trung người Công giáo đông thứ hai là Kyushu, nơi Giáo hội địa phương được thừa hưởng đức tin từ “các Kitô hữu hầm trú”, trong thời kỳ Kitô giáo bị cấm cách trong các cuộc bách hại (1639-1873). Riêng tổng giáo phận Nagasaki có 60,933 tín hữu.
Số tín hữu Công giáo giảm
Theo thống kê năm 2018, trong 10 năm qua, số người Công giáo đăng ký tại nước này giảm dần (440.893 người Công giáo năm 2018 so với 447.886 năm 2008).
Trong năm 2018, số người trưởng thành được rửa tội vượt quá số trẻ sơ sinh: 2.689 người lớn so với 2.329 trẻ sơ sinh. Số người chịu phép rửa tội cũng giảm sút kể từ năm 2006 (518 người năm 2018 so với 7.193 người năm 2006).
Giáo sĩ người ngoại quốc
Hàng giáo sĩ Nhật Bản có 1.366 vị, gồm các Giám mục, linh mục và phó tế, trong đó có 529 vị là người ngoại quốc. Vào cuối năm 2018, Giáo hội Nhật có 74 chủng sinh, trong đó có 31 chủng sinh thuộc giáo phận.
Trường học Công giáo
Giáo hội Công giáo Nhật có 776 trường mầm non, tiểu học, trung học và 44 trường sau trung học, trong đó có 19 đại học. (ME 11/10/2019)
Hồng Thủy – Vatican